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基因分析自动化的最后一块拼图,Lifebit 搭建云端 DNA 智能识别平台

邓三三 · 2018-07-24
人工智能将会成为基因时代背后的推手吗?

核心提示:

  1.  基因分析的第二步——测序之后的数据分析与信息提取,至今还非常依赖研究人员的经验,因此难以实现自动化。

  2. Lifebit 的云端 DNA 识别系统希望利用人工智能学习研究人员的数据处理方法,不断优化自身的分析模型,从而做到像人类一样推断并提取 DNA 内包含的有效信息。

要从 DNA 样本中获取有意义的信息,需要经过两个步骤。第一步是 DNA 测序,这一步骤目前已经可以通过自动化的方法实现,几乎不需要人为操作,且每次测序成本已经跌破 1000 美元。业界普遍认为,随着技术的发展,这部分成本降至 100 美元也仅仅是时间问题。第二步则是对测序后的 DNA 数据进行分析,这一步骤非常复杂耗时,需要高技能专家进行操作,因此这一步骤转向自动化的进展也十分缓慢。

坐标与伦敦的创企 Lifebit 试图提供这个问题的解决方案。近期,Lifebit 上线了首款产品——由人工智能驱动的云端基因数据分析平台 Deploit,公司声称这是全球首款人工智能基因平台。这个系统能像人类一样对于 DNA 内包含的有效信息进行推断。

Deploit 会学习输入的数据以及研究人员对这些数据进行的操作,从而调整自己的分析模式,达到前所未有的自动化程度。即使研究者们没有经过数据分析与计算生物学的相关训练,这个可扩展性极强的模块化系统也能够帮助他们从庞杂的数据中获得有价值的洞见。另外,Deploit 与所有主流云服务提供商都达成了合作,以此提高分析速度,提供流畅的用户体验。

创始人 Maria Chatzou 表示,Deploit 能够让研究机构以更高的效率、更低的成本进行基因数据分析。但这仅是 Lifebit 愿景的第一步,这家公司希望最终搭建一个完整的云端基因识别系统,在数据分析这一步骤完全取代人工。

Chatzou 解释道:“我们即将进入一个新的时代,每个人的一生中都会经历许多次基因检测,基因的作用涵盖人类生活的方方面面——从疾病诊断到精准医疗,从食品安全到环境保护。在改变到来之时,我们希望 Lifebit 能处在浪潮的中心。” 

基因分析自动化的最后一块拼图,Lifebit 搭建云端 DNA 智能识别平台

Lifebit 团队

目前,市面上的其他 DNA 分析平台如 DNAnecus 和 SevenBridges, 在灵活性方面都有些欠缺,不能很好地整合进生物信息学家的工作流程中;价格较为高昂,分析过程不透明;且无法在不断的分析中主动学习、自我提升。依靠人工智能的机器学习功能,Deploit 能够填补以上不足,为相关研究者与公司打造新一代的基因研究工具。

发布新产品的同时,Lifebit 宣布获得 300 万美元的种子轮投资,由 Pentech Ventures 和 Connect Ventures 领投,参投方包括 Beacon Capital 和 Tiny VC。Lifebit 表示,这笔资金将用于 Deploit 平台的后续开发以及工程师团队的扩展。目前工程师团队的成员们拥有来自 Google、Illumina 等公司的背景。

Lifebit 于 2017 年 4 月创立,创始人Maria Chatzou 与 Pablo Prieto Barja 是来自剑桥大学的两位博士。2017 年 7 月,这家公司便入选了 Techstars 的孵化项目

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